MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 7255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015942	GCTT	2	8	458187	458194	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_015942	TA	3	6	458773	458778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_015942	CTGCC	2	10	459677	459686	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1004	NC_015942	GTC	2	6	459704	459709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_015942	GT	3	6	459730	459735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015942	TGT	2	6	459763	459768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_015942	GATCA	2	10	459777	459786	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1008	NC_015942	ATGTTT	2	12	459795	459806	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015942	TCC	2	6	459895	459900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_015942	TCA	2	6	459965	459970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_015942	AAT	2	6	459983	459988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_015942	GCT	2	6	460027	460032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_015942	CCT	2	6	460060	460065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_015942	CGTC	2	8	460070	460077	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_015942	TA	3	6	460089	460094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015942	CAT	2	6	460113	460118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_015942	TGT	2	6	460652	460657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015942	CTAT	2	8	460659	460666	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_015942	TGT	2	6	460675	460680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015942	AGATG	2	10	460700	460709	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015942	CTGCC	2	10	463352	463361	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1022	NC_015942	GCA	2	6	463383	463388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_015942	ATTG	2	8	463438	463445	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_015942	TGG	2	6	463451	463456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015942	ATC	2	6	463490	463495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_015942	CAG	2	6	463502	463507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_015942	CAA	2	6	463529	463534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_015942	CA	3	6	463547	463552	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_015942	A	7	7	463589	463595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_015942	ATG	2	6	463611	463616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015942	GT	3	6	463641	463646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015942	CAC	2	6	463699	463704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_015942	TCC	2	6	463799	463804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_015942	AAC	2	6	463836	463841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_015942	CGA	2	6	463852	463857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_015942	GCG	2	6	466513	466518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_015942	CGC	2	6	466535	466540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_015942	CT	3	6	466551	466556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_015942	CAAG	2	8	466560	466567	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_015942	CGG	2	6	466692	466697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_015942	GCC	2	6	466745	466750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_015942	GC	3	6	466770	466775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_015942	ACC	2	6	466881	466886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_015942	CCT	2	6	466902	466907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_015942	CTG	2	6	467012	467017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_015942	CGAT	2	8	467077	467084	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_015942	TGCT	2	8	467112	467119	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_015942	G	7	7	467128	467134	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015942	CAG	2	6	467164	467169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_015942	CAA	2	6	467229	467234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_015942	GGA	2	6	467241	467246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_015942	TC	3	6	467271	467276	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_015942	ACC	2	6	467302	467307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_015942	CTG	2	6	467316	467321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_015942	GGC	2	6	467322	467327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_015942	GCGG	2	8	467336	467343	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_015942	AGA	2	6	467361	467366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015942	GGAT	2	8	467380	467387	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015942	GGA	2	6	467439	467444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_015942	CG	3	6	467625	467630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_015942	GGT	2	6	467745	467750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015942	GC	3	6	467772	467777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_015942	GCG	2	6	467801	467806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_015942	GCA	2	6	467930	467935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_015942	GCC	2	6	468010	468015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_015942	GGAGGT	2	12	468078	468089	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015942	GC	3	6	468090	468095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_015942	GGCA	2	8	468104	468111	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_015942	AAC	2	6	468118	468123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_015942	CTCC	2	8	468220	468227	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1071	NC_015942	ATC	2	6	468251	468256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_015942	CG	3	6	468264	468269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_015942	CTG	2	6	468373	468378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_015942	GAT	2	6	468394	468399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_015942	TGC	2	6	468503	468508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_015942	GC	3	6	468507	468512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_015942	GAT	2	6	468544	468549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_015942	ATCG	2	8	468610	468617	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_015942	CGG	2	6	468728	468733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_015942	TCA	2	6	468749	468754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_015942	C	7	7	468801	468807	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1082	NC_015942	CCTG	2	8	468817	468824	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_015942	TGA	2	6	468851	468856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_015942	GTC	2	6	468862	468867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_015942	C	6	6	468867	468872	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1086	NC_015942	TCC	2	6	468926	468931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_015942	CGCC	2	8	469068	469075	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1088	NC_015942	ACGA	2	8	469076	469083	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_015942	TCA	2	6	469086	469091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_015942	TTG	3	9	469180	469188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_015942	CTG	2	6	469195	469200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_015942	TGGA	2	8	469220	469227	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015942	AAT	2	6	469233	469238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015942	ACA	2	6	471821	471826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_015942	T	7	7	471852	471858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_015942	TGGA	2	8	471895	471902	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_015942	TGC	2	6	472059	472064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_015942	GGT	2	6	472091	472096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_015942	GA	3	6	472155	472160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_015942	CCG	2	6	472181	472186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_015942	GTGC	2	8	472246	472253	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1102	NC_015942	CTG	2	6	472278	472283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_015942	GAT	2	6	472302	472307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015942	CGT	2	6	472396	472401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_015942	ATC	2	6	472406	472411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_015942	CCG	3	9	472483	472491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_015942	CTT	2	6	472549	472554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_015942	CAG	2	6	472592	472597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_015942	CCG	2	6	472616	472621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_015942	CAA	2	6	472703	472708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_015942	GCA	2	6	472777	472782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_015942	GCGA	2	8	472871	472878	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1113	NC_015942	GTG	2	6	472950	472955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_015942	AGA	2	6	472963	472968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_015942	GATC	2	8	472984	472991	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_015942	GTT	2	6	473032	473037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_015942	TGC	2	6	473056	473061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_015942	TGG	2	6	473073	473078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_015942	TTCC	2	8	473252	473259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_015942	TCAG	2	8	473265	473272	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_015942	GATG	2	8	473312	473319	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015942	GAA	2	6	473322	473327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_015942	GGGT	2	8	473341	473348	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015942	TCA	2	6	473365	473370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_015942	ACTG	2	8	473392	473399	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1126	NC_015942	GCC	2	6	473413	473418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_015942	CAT	2	6	473455	473460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_015942	CAA	2	6	473473	473478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_015942	GCG	2	6	473489	473494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_015942	GGT	2	6	473504	473509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_015942	CATG	2	8	473518	473525	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1132	NC_015942	CCA	2	6	473585	473590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_015942	CAA	3	9	473689	473697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_015942	CAG	2	6	473703	473708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_015942	AGG	2	6	473720	473725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1452	NC_015942	TCAT	2	8	581103	581110	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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